Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gfra4Q9JJT2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms