Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Caln1Q9JJG7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Caln1Q9JJG7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms