Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lmbr1Q9JIT0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lmbr1Q9JIT0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms