Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pus3Q9JI38 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms