Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Tmod3Q9JHJ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod3Q9JHJ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmod3Q9JHJ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Tmod3Q9JHJ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmod3Q9JHJ0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms