Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

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Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Jph3Q9ET77 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jph3Q9ET77 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms