Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pgpep1Q9ESW8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms