Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Vmn1r41Q9EQ44 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r41Q9EQ44 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Vmn1r41Q9EQ44 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r41Q9EQ44 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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