Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ropn1lQ9EQ00 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ropn1lQ9EQ00 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms