Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf6Q9DBU5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf6Q9DBU5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms