Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tm9sf1Q9DBU0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tm9sf1Q9DBU0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms