Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr53Q9DB94 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Wdr53Q9DB94 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms