Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc1Q9DB70 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fundc1Q9DB70 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms