Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pop5Q9DB28 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms