Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9DA42 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9DA42 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DA42 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DA42 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DA42 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9DA42 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9DA42 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9DA42 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms