Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smco2Q9DA21 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms