Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn23Q9D7D7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms