Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc3Q9D6Y1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc3Q9D6Y1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc3Q9D6Y1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc3Q9D6Y1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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