Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Ttc9bQ9D6E4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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