Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc7Q9D541 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc7Q9D541 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms