Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc83Q9D4V3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms