Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Efhd1Q9D4J1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Efhd1Q9D4J1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms