Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Obox1Q9D350 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms