Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pramef12Q9D2F1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pramef12Q9D2F1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms