Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Trappc6bQ9D289 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trappc6bQ9D289 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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