Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps28Q9D1C8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps28Q9D1C8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms