Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Snf8Q9CZ28 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snf8Q9CZ28 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms