Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnot11Q9CWN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot11Q9CWN7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms