Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF2

Tubb2b, Tubulin beta-2B chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2bQ9CWF2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubb2bQ9CWF2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubb2bQ9CWF2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms