Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpa3Q9CQ71 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms