Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trim8Q99PJ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms