Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4dQ99N05 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ms4a4dQ99N05 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms