Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cttnbp2nlQ99LJ0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms