Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lysmd3Q99LE3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms