Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf19Q99KP6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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