Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tlcd1Q99JT6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tlcd1Q99JT6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms