Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apobec3Q99J72 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms