Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CsprsQ99388 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms