Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rnf144aQ925F3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf144aQ925F3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms