Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Creb3l3Q91XE9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Creb3l3Q91XE9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms