Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppargc1bQ8VHJ7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ppargc1bQ8VHJ7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms