Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rhbdd2Q8VEK2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rhbdd2Q8VEK2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms