Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ApobrQ8VBT6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms