Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ClmpQ8R373 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ClmpQ8R373 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms