Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc12Q8R344 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms