Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxc12Q8K5B8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxc12Q8K5B8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxc12Q8K5B8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Hoxc12Q8K5B8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxc12Q8K5B8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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