Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casc3Q8K3W3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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