Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssh3Q8K330 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ssh3Q8K330 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssh3Q8K330 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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