Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SbsnQ8CIT9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms