Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
9030612E09RikQ8CE20 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms